Luis  Carlos Rodriguez Zapata

Luis Carlos Rodríguez Zapata

NOMBRAMIENTO
Investigador Titular C
UNIDAD ACADÉMICA
Biotecnología
SNI
Nivel II
TELÉFONO
(999)-981-39-43, Ext: 206
CORREO INSTITUCIONAL
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VIDEO: Transformación genética de plantas


EDUCACIÓN


  • Doctorado. Doctorado en Ciencias y Biotecnología de Plantas. Centro de investigación Científica de Yucatán. 1998. Postdoctorado. Posdoctoral en Biología Molecular y Bioquímica de Plantas.
  • Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional Autónoma de México. Cuernavaca, Morelos. 2000.
  • Postdoctorado. Posdoctoral en Biología Molecular de Plantas. Department of Biochemistry and Cell Biology, State University of New York at Stony Brook. 2002.
  • Postdoctorado. Posdoctoral en Biología Molecular de plantas. Cinvestav-Unidad Irapuato. 2009.

LÍNEA ACTUAL DE INVESTIGACIÓN


AGROBIOTECNOLOGÍA

Hemos combinado diferentes metodologías de varias diciplinas de la Ciencias Biológicas. Esto con el fin de desarrollar una plataforma multidisciplinaria para comprender mejor los productos de los genes que participan en una manera coordinada entre ellos. Esto para comprender el mecanismo de respuesta y tolerancia de un particular estrés abiótico hasta el punto de la muerte de la planta debido a su marchitamiento. Estos genes se pueden usar para desarrollar nuevos productos biotecnológicos con el potencial de no afectar el rendimiento en los cultivares comerciales, independientemente de los cambios climáticos causados por el calentamiento global. Nuestra investigación se ha centrado en definir los diferentes elementos de señalización implicados en un mecanismo molecular en respuesta a un estrés abiótico en plantas con valor económico para México. Esto se ha hecho utilizando tecnología avanzada "omics" (metabolómica, genómica y proteómica). Por lo tanto, los experimentos en fisiología y bioquímica nos ayudaron a identificar los diferentes límites que una planta puede tener sabiamente en presencia de un estrés abiótico. Esto con la finalidad de establecer información relevante para llevar a cabo una secuenciación masiva, y usar bioinformática para obtener y ensamblar pequeñas secuencias hasta definir genes completos y crear la red de genes involucrados en la respuesta al estrés. Con los ID de los genes y su información genética y su comparación con otras especies, pudimos establecer su correlación con otras diferentes especies y, de nuevo, con la ayuda de un conjunto de nuevas herramientas de bioinformática, predecir todas las líneas ancestrales y la historia de evolución de las familias multigénicas. Incluso si la complejidad de la familia se diera por la poliploidía o redundancia genética. Luego usamos los genes que tienen una función preestablecida por su análisis in silico, y usamos técnicas de biología molecular para editar los genomas (CRISPR/Cas9). Con los nuevos genotipos se puede establecer hasta obtener líneas transgénicas puras a partir de su transformación por Agrobacterium o bio-balística. En nuestro grupo de trabajo, desarrollamos una plataforma multidisciplinaria utilizando diferentes metodologías que nos permitieron obtener patentes internacionales, así como la formación de recursos humanos con conocimientos multidisciplinarios que han resultado del trabajo mostrado al desarrollar este tipo de investigación.

PROYECTOS VIGENTES

  • ESTUDIO DEL TRANSCRIPTOMA Y PROTEOMA DE PAPAYA (Carica papaya L.) EN RESPUESTA A ESTRÉS HÍDRICO: IDENTIFICACIÓN DE GENES CON POTENCIAL PARA MEJORAR SU EFICIENCIA EN EL USO DE AGUA. Convocatoria de Investigación Científica Básica 2013 (Clave del CONACyT: 221208). CONACyT

Patentes o Desarrollos Tecnológicos


  • Luis Carlos Rodríguez Zapata, Luis Joel Figueroa Yáñez, Alejandro Pereira Santana, Enrique Castaño de la Serna. . Factor de transcripción de Carica papaya y su aplicación para obtener plantas tolerantes a temperaturas extremas. Numero de Solicitud Internacional: PCT/MX2017/000071. estatus: presentada el 30 de junio 2017. Número de Publicación Internacional: WO2018/009050. Fecha de Publicación Internacional: 11 de enero del 2018. USA. (2018).
  • Luis Carlos Rodríguez Zapata, Luis Joel Figueroa Yáñez, Alejandro Pereira Santana, Enrique Castaño de la Serna. . Factor de transcripción de Carica papaya y su aplicación para obtener plantas tolerantes a temperaturas extremas. Solicitud de expediente: MX/A/2016/008991; FOLIO: MX/E/2016/047455. Estatus: presentada el 8 de Julio 2016. MX. (2016).
  • Luis Carlos Rodríguez Zapata, Ana Ly Arroyo Herrera, Luis Joel Figueroa Yáñez, Enrique Castaño de la Serna. . Factor de transcripción aislado de Carica papaya var. Maradol que confiere tolerancia al estrés abiótico en plantas y método de transformación. . Solicitud de expediente: MX/A/2015/017242; folio: MX/E/2015/091313. Estatus: presentada en 14 de diciembre 2015. Fecha de Puesta en Circulación: 11 de Julio de 2017. MX. (2015).

PUBLICACIONES RECIENTES


  • Pereira-Santana A., Gamboa-Tuz S. D., Zhao Tao, Schranz M. Eric, Vinuesa P., Bayona, A., Rodríguez-Zapata, L. C., Castano E. . Fibrillarin evolution through the Tree of life: Comparative genomics and microsynteny network analyses provide new insights into the evolutionary history of Fibrillarin. PLOS Computational Biology, 16(10): e1008318, (2020). } https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008318.
  • Carrillo-Bermejo Evelyn A., Gamboa-Tuz Samuel David, Pereira-Santana Alejandro, Keb-Llanes Miguel A., Castaño Enrique, Figueroa-Yañez Luis Joel, Rodriguez-Zapata Luis C. . The SoNAP gene from sugarcane (Saccharum officinarum L.) encodes a senescence-associated NAC transcription factor involved in the response to osmotic and salt Stress. Journal of Plant Research. , 133(6): 897-909 , (2020). DOI: 10.1007/s10265-020-01230-y.
  • Zamora-Briseño, J.A., Pereira-Santana, A., Reyes-Hernández, S.J., Cerqueda-García, D., Castaño, E., Rodríguez-Zapata, L.C. . Towards an understanding of the role of intrinsic protein disorder on plant adaptation to environmental challenges. Cell Stress and Chaperones, 26: 141-150, (2021). https://doi.org/10.1007/s12192-020-01162-5.
  • Guillen-Chable, F.1; Rodríguez Corona, U.2; Pereira-Santana, A.3; Bayona, A.4; Rodríguez-Zapata, L.C.5; Aquino, C.6; Šebestová, L.7; Vitale, N.8; Hozak, P.9; Castano, E.10 . Fibrillarin Ribonuclease Activity is Dependent on the GAR Domain and Modulated by Phospholipids. Cells, 9(5):1143-1165., (2020). https://doi.org/10.3390/cells9051143.
  • Reyes-Hernández, S.J.*+1, Zamora-Briseño, J.A.*+2, Cerqueda-García, D.3, Castaño, E.4, Rodríguez-Zapata L.C.+5 . Alterations in the sap-associated microbiota of Carica papaya in response to drought stress. Symbiosis., 81: 93-100, (2020). https://doi.org/10.1007/s13199-020-00682-z.

RECONOCIMIENTOS O PREMIOS


  • 2002. -Membresía en el Sistema Nacional de investigadores. Candidato a Investigador Nacional: del 1 de Julio del 2002 al 30 de junio del 2005. Investigador Nacional Nivel 1: del 1 de Enero del 2006 al 31 de Diciembre del 2016. Investigador Nacional Nivel 2: del 1 de Enero del 2017 al 31de Diciembre del 2025. CONACYT.
  • 2005. International Foundation For Science 2005. “Use of functional genomics to identify low temperature responsive/tolerants-genes in Musa balbisinana (BB), a tolerant plant to abiotic stress-First part”. Estocolmo, Suecia.
  • 2005. Generation Challenge Programe Fellowship 2005. “Development of COS markers for drought tolerance for Musa germplasm”. IPGRI-INIBAB/University of Leicester. Francia.

SITIOS RECOMENDADOS


Responsable de la Información: Luis Carlos Rodríguez Zapata
Fecha de última actualización: 23 de febrero de 2021.